KEANEKARAGAMAN GENETIK, MORFOLOGI DAN MORFOMETRI IKAN ENDEMIK DI DANAU RAWA PENING DENGAN PENDEKATAN DNA BARCODING

Nisrina Septi Haryani; Agus Hartoko; Diah Ayuningrum

doi:10.14710/ijfst.19.2.90-96

DOI: https://doi.org/10.14710/ijfst.19.2.90-96

KEANEKARAGAMAN GENETIK, MORFOLOGI DAN MORFOMETRI IKAN ENDEMIK DI DANAU RAWA PENING DENGAN PENDEKATAN DNA BARCODING

*Nisrina Septi Haryani - Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan, Departemen Sumberdaya Akuatik, Universitas Diponegoro, Jl. Prof. Sudarto, SH, Tembalang, Semarang, Indonesia 50275, Indonesia

Agus Hartoko - Departemen Sumberdaya Akuatik, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Indonesia

Diah Ayuningrum - Departemen Sumberdaya Akuatik, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Indonesia

under http://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0.

BibTex Citation Data :

@article{IJFST43643,
    author = {Nisrina Haryani and Agus Hartoko and Diah Ayuningrum},
    title = {KEANEKARAGAMAN GENETIK, MORFOLOGI DAN MORFOMETRI IKAN ENDEMIK DI DANAU RAWA PENING DENGAN PENDEKATAN DNA BARCODING},
    journal = {Saintek Perikanan : Indonesian Journal of Fisheries Science and Technology},
  volume = {19},
    number = {2},
    year = {2023},
    keywords = {Endemik; Keanekaragaman; Rawa Pening; Wader.},
    abstract = {Rawa Pening terletak di Jawa tengah adalah danau terbentuk alami melalui proses letusan vulkanik yang mengalurkan lava  basalt  dan menyumbat aliran Kali Pening daerah Tuntang yang berakibat lembah pening yang berhutan tropik berubah menjadi rawa. Ikan Endemik atau ikan asli yang terdapat di Rawa Pening yaitu ikan Wader. Penelitian di Danau Rawa Pening pada tahun 2006 diketahui memiliki keanekaragaman ikan Wader yaitu Wader Pari ( R. lateristriata ), Putih ( R. jacobsoni ), Andong ( B. canchonius ), Cakul ( P. binotatus ) dan Ijo ( O. vittatus ). Pentingnya untuk mengidentifikasi secara morfologi dan molekuler dikarenakan ikan Wader ini terdapat banyak jenis di Rawa Pening sebagai bahan inventarisasi data spesies ikan dan untuk mengetahui hubungan filogenetik pada area Danau Rawa Pening. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui informasi mengenai jenis spesies ikan Wader di Rawa Pening berdasarkan perbandingan morfologi teknik morfometri dan molekuler teknik DNA  Barcoding  dan hubungan filogenetik serta tingkat keragaman genetiknya. Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Maret-Oktober 2021. Metode yang dilakukan meliputi analisis morfologi dari morfometri dan meristiknya, analisis molekuler dengan DNA barcoding, serta analisis data menggunakan software MEGA-X dan dnaSP. Hasil penelitian didapatkan ikan 33 individu, kemudian analisis morfologi dan molekuler dapat diketahui 3 spesies ikan yaitu kode W.P yaitu ikan Lumajang ( Cycloceilichthys enoplos ) dengan kemiripan sebesar 97,65%, kode W.I yaitu ikan Wader Ijo ( Osteochilus vittatus ) dengan kemiripan sebesar 100%, dan kode W.B yaitu ikan Wader Bintik Dua ( Barbodes binotatus ) dengan kemiripan sebesar 99,83%. Nilai keragaman genetik sampel ikan wader yang didapatkan di Danau Rawa Pening sebesar 0,8333 termasuk kedalam kategori keragaman genetik tinggi.},
   issn = {2549-0885},   pages = {90--96}  doi = {10.14710/ijfst.19.2.90-96},
    url = {https://ejournal.undip.ac.id/index.php/saintek/article/view/43643}
}

Citation Format:

Abstract

Rawa Pening terletak di Jawa tengah adalah danau terbentuk alami melalui proses letusan vulkanik yang mengalurkan lava basalt dan menyumbat aliran Kali Pening daerah Tuntang yang berakibat lembah pening yang berhutan tropik berubah menjadi rawa. Ikan Endemik atau ikan asli yang terdapat di Rawa Pening yaitu ikan Wader. Penelitian di Danau Rawa Pening pada tahun 2006 diketahui memiliki keanekaragaman ikan Wader yaitu Wader Pari (R. lateristriata), Putih (R. jacobsoni), Andong (B. canchonius), Cakul (P. binotatus) dan Ijo (O. vittatus). Pentingnya untuk mengidentifikasi secara morfologi dan molekuler dikarenakan ikan Wader ini terdapat banyak jenis di Rawa Pening sebagai bahan inventarisasi data spesies ikan dan untuk mengetahui hubungan filogenetik pada area Danau Rawa Pening. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui informasi mengenai jenis spesies ikan Wader di Rawa Pening berdasarkan perbandingan morfologi teknik morfometri dan molekuler teknik DNA Barcoding dan hubungan filogenetik serta tingkat keragaman genetiknya. Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Maret-Oktober 2021. Metode yang dilakukan meliputi analisis morfologi dari morfometri dan meristiknya, analisis molekuler dengan DNA barcoding, serta analisis data menggunakan software MEGA-X dan dnaSP. Hasil penelitian didapatkan ikan 33 individu, kemudian analisis morfologi dan molekuler dapat diketahui 3 spesies ikan yaitu kode W.P yaitu ikan Lumajang (Cycloceilichthys enoplos) dengan kemiripan sebesar 97,65%, kode W.I yaitu ikan Wader Ijo (Osteochilus vittatus) dengan kemiripan sebesar 100%, dan kode W.B yaitu ikan Wader Bintik Dua (Barbodes binotatus) dengan kemiripan sebesar 99,83%. Nilai keragaman genetik sampel ikan wader yang didapatkan di Danau Rawa Pening sebesar 0,8333 termasuk kedalam kategori keragaman genetik tinggi.

Fulltext View|Download

Keywords: Endemik; Keanekaragaman; Rawa Pening; Wader.

Article Metrics:

Article Info

Section: Research Articles

Language : ID

In Vol 19, No 2 (2023): SAINTEK PERIKANAN

Recent articles

PENAMBAHAN SUMBER KARBON DALAM MENEKAN PERKEMBANGAN BAKTERI Vibrio sp. PADA BUDIDAYA UDANG VANAME (Litopenaeus vannamei) SISTEM BIOFLOK ADAPTASI MATA IKAN TONGKOL (Euthynnus affinis) HASIL TANGKAPAN PUKAT CINCIN DI SELAT SUNDA KEANEKARAGAMAN GENETIK, MORFOLOGI DAN MORFOMETRI IKAN ENDEMIK DI DANAU RAWA PENING DENGAN PENDEKATAN DNA BARCODING More recent articles

Most cited articles

PRODUKTIVITAS PERIKANAN TANGKAP KOTA TEGAL VALUASI EKONOMI SUMBERDAYA MANGROVE DI KELURAHAN MANGUNHARJO, KECAMATAN TUGU, KOTA SEMARANG Economic Valuation of Mangrove Resources in the Mangunharjo Village Tugu Sub District, Semarang City Productivity and Feasibility of Tuna Longliner on Cilacap District Central Java STATUS KEBERLANJUTAN DIMENSI EKOLOGI DALAM PENGEMBANGAN KAWASAN MINAPOLITAN BERKELANJUTAN BERBASIS PERIKANAN BUDIDAYA AIR TAWAR DI KABUPATEN MAGELANG Effect of Bakers Yeast, Vitamin B12, and Vitamin C as Nutritional Improvement of Food on the Density Production of Brachionus plicatilis More cited articles

Anggara, P. 2020. Keanekaragaman Jenis Ikan (Cypriniformes: Cyprinidae) di Sungai Batang Tembesi Kabupaten Merangin. BIOCOLONY, 3(1), 25-38
Avise, J. C., J.E. Neigel dan Arnold, J. 1984. Demographic influences on mitochondrial DNA lineage survivorship in animal populations. Journal of Molecular Evolution, 20(2), 99-105
Barcaccia G., M.Lucchin, dan M.Cassandro . 2016. DNA barcoding as a molecular tool to track down mislabeling and food privacy. Diversity. 8(2):1-16
De Jong, M.A., N.Wahlberg, M. Van Eijk, P.M. Brakefield dan B.J Zwaan. 2011. Mitochondrial DNA Signature for Range-Wide Populations of Bicyclus anynana sugest a rapid expansion from Recent Refrugia. PloS one. 6(6):1-5
Fadhil, R., Z. A Muchlisin, dan W. Sari. 2016. Hubungan Panjang-Berat Dan Morfometrik Ikan Julung-Julung (Zenarchopterus dispar) dari Perairan Pantai Utara Aceh. Jurnal Ilmiah Mahasiswa Kelautan Dan Perikanan Unsyiah, 1(1), 146–159
Firdaus, N., dan H. Hamdani. 2016. Pengaruh Pemberian Lemna Sp. Sebagai Pakan Dalam Budidaya Ikan Nilem Organik. Jurnal Perikanan Dan Kelautan, VIII(1), 9–13
Gerry, S. P., M. Vogelzang, J.Ascher dan D. J. Ellerby. 2013. Variation in the diet and feeding morphology of polyphenic Lepomis macrochirus. Journal of Fish Biology, 82(1), 338-346
Grant, W. A. S., dan B.W. Bowen. 1998. Shallow population histories in deep evolutionary lineages of marine fishes: insights from sardines and anchovies and lessons for conservation. Journal of heredity, 89(5), 415-426
HALL, B.G. 2001. Phylogenetic trees made easy: A how-to manual for molecular biologists. Sinauer Associates, Inc., Sunderland
Haryono. 2001. Variasi Morfologi dan Morfometri Ikan Dokun (Puntius Lateristriga) di Sumatera. Jurnal Biota Vol. VI (3): 109-116. ISSN 0853-8670
Hebert, P. D. N., A. Cywinska, S.L. Ball dan J.R. DeWaard. 2003. Biological identifications through DNA barcodes. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 270(1512), 313–321
Hebert, P. D. N., E.H.Penton, J.M. Burns, D.H. Janzen dan W. Hallwachs. 2004. Ten species in one: DNA barcoding reveals cryptic species in the neotropical skipper butterfly Astraptes fulgerator. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 101(41), 14812–14817
HILLIS, D.M., B.K. MARBLE and C. MORITZ. 1996. Applications of molecular systematics: The state of the field and a look to the future. In: Hillis, D.M.C. MORITZ and B.K. MABLE (Eds.). 1996. Molecular systematics. 2nd Ed. Sinauer Associates, Inc., Sunderland. pp. 515- 543
Kumar, S., K. Tamura dan M. Nei. 2004. MEGA3: integrated software for molecular evolutionary genetics analysis and sequence alignment. Briefings in bioinformatics, 5(2), 150-163
Nei, M. 1987. Molecular Evolutionary genetics. Columbia University Press
Rinanda, T. 2011. Analisis sekuensing 16S rRNA di bidang mikrobiologi. Jurnal Kedokteran Syiah Kuala, 11(3), 172-177
Rochmatin, S.Y., A. Solichin, S.W. Saputra. 2014. Aspek Pertumbuhan dan Reproduksi Ikan Nilem (Osteochilus vittatus) di Perairan Rawa Pening Kecamatan Tuntang Kabupaten Semarang. Diponegoro Journal of Maquares, 3(3), 153–159
Rogers, A. R., dan H. Harpending, H. 1992. Population growth makes waves in the distribution of pairwise genetic differences. Molecular biology and evolution, 9(3), 552-569
Sittadewi, E. H. 2011. Kondisi Lahan Pasang Surut Kawasan Rawa Pening Dan Potensi Pemanfaatannya. Jurnal Teknologi Lingkungan, 9(3), 294–301
Situmorang, T. S., T.A. Barus dan H. Wahyuningsih. 2013. Studi Komparasi Jenis Makanan Ikan Keperas (Puntius Binotatus) Di Sungai Aek Pahu Tombak, Aek Pahu Hutamosu Dan Sungai Parbotikan Kecamatan Batang Toru Tapanuli Selatan Toberni. Jurnal perikananan dan kelautan, 18(2):48–58
Smith, H.M. 1945: The Freshwater Fishes of Siam or Thailand. Bull. U.S. Nat. Mus., 188, XI-622 pp
Subari, A., A. Razak dan R. Sumarmin. 2021. Phylogenetic Analysis of Rasbora spp. Based on the Mitochondrial DNA COI gene in Harapan Forest. Jurnal Biologi Tropis, 21(1), 89
Sukmono, T dan M. Margaretha. 2017. Ikan Air Tawar di Ekosistem Bukit Tiga Puluh.Yayasan Konservasi Ekosistem Hutan Sumatera dan Frankfurt Zoological Society. ISBN: 978-602-51102-0-7
Sutardja, OS. 1980. Beberapa aspek biologi ikan lalawak Puntius bramoides (Cuvier & Valenciennes) di Waduk Jatiluhur Jawa Barat. Karya Ilmiah. Fakultas Perikanan IPB Bogor. 56 hal
Triandiza, T dan H. Madduppa, H. 2018. Aplikasi Analisa Morfologi dan DNA Barcoding pada Penentuan Jenis Kepiting Porcelain (Pisidia sp.) yang Berasal dari Pulau Tunda, Banten. Jurnal Sumberdaya Akuatik Indopasifik, 2(November), 81–90
Ward, R. D., T.S. Zemlak, B.H. Innes, P.R. Last dan P.D.N. Hebert. 2005. DNA barcoding Australia’s fish species. Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, 360(1462), 1847–1857
Weber, M., dan L.F. de Beaufort. 1916. The Fishes of Indo Australian Archipleago (Ostariophysi II: Cyprinidae, Apodes. Synbranchi). E.J. Brill Leiden Ltd
Wibowo, A. 2012. Keragaman Genetik ikan Semah (Tor tambroides BLEKER 1854) Di Sungai Manna , Bengkulu Dan Sungai Semanka , Lampung Genetic Diversity Of Masher ( Tor Tambroides Bleker 1854 ) In Manna River , Bengkulu And Semanka River , Lampung. Bawal, 4(308), 105–112
Zein, M. S. A., dan Y.S. Fitriana. 2012. Teknik molekuler untuk identifikasi spesies ordo Cetartiodactyla menggunakan DNA barcode. Zoo Indonesia, 21(2), 1–8
Zulfia, N., dan Aisyah. 2013. Status Trofik Perairan Rawa Pening Ditinjau Dari Kandungan unsur hara (No3 dan PO4) serta klorofil-a. Bawal, 5(3), 189–199

Last update:

No citation recorded.

Last update: 2025-07-01 00:53:44

No citation recorded.

under http://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0.

Authors who submit manuscripts do so with the understanding that, if accepted for publication, the copyright of the article will be transferred to Saintek Perikanan: Indonesian Journal of Fisheries Science and Technology, Faculty of Fisheries and Marine Science, Diponegoro University as the journal publisher. The copyright includes the rights to reproduce and distribute the article in all forms and media, including reprints, photographs, microfilm, and similar reproductions, as well as translations.

Articles published in this journal are licensed under a Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (CC BY-SA 4.0). This license allows others to use, share, adapt, and redistribute the material in any medium or format, provided appropriate credit is given to the original author(s) and the journal, and that any derivative works are distributed under the same license.

Saintek Perikanan: Indonesian Journal of Fisheries Science and Technology, Faculty of Fisheries and Marine Science, Universitas Diponegoro, and the editors make every effort to ensure the accuracy of all data, opinions, and statements published in the journal. However, the content of each article and advertisement published in Saintek Perikanan is the sole responsibility of the respective authors and advertisers.